一年生苗的初期症状是茎基部变成褐色，叶片失色，稍向下垂。而后感病部位迅速向上延伸，叶下垂而不脱落。感病茎部皮层缢缩，内皮组织腐烂呈海绵状或粉末状，灰白色，其中有许多黑色的细小菌核，病菌能侵入木质部，褐色中空的髓部也有小菌核产生。最后扩展到根部，使根皮层腐烂，如拔病苗，仅能拔出木质部。一年生移栽苗以及扦插苗症状类似。

在茎基部持续受到高温灼伤，或受到机械损伤等，均有利于病菌侵入而发病。梅雨季长，发病严重。发病时间一般在梅雨开始后10～15天。

1.加强银杏园管理。对栽植银杏树的园地，切实做好冬季清园工作，及时清除田园里的残枝落叶，以减少越冬菌源；结合银杏园培土，及时铲除园中杂草；在雨季，及时搞好清沟排渍，以降低田间湿度，增强树苗的抗病性。

2.加强肥料管理。要求底肥和追肥均应以有机肥料为主，以促进树苗生长健壮，提高植株的抗病能力。

3.加强温光管理。在高温季节，在苗床架设遮阳棚、加盖遮阳网；在发病季节，可用稻草覆盖苗床，从而降低光照强度、土壤温度，降低发病率，促进银杏苗木生长健壮。

4.加强化学防治。化学药剂可选用30%恶霉灵水剂 （又名国光地爱）1000-2000倍液，或62.25％代森锰锌·腈菌唑可湿性粉剂600倍液，或10％多抗霉素可湿性粉剂 800倍液均匀喷洒在幼苗或成龄银杏树叶片上。