对于松树来说，毁灭性的流行病害当属松材线虫病了，是松树的—种毁灭性流行病害，紫金山是我国松材线虫病的首先发现地，受此病危害已达30年，在这30年中，紫金山投入了4000多万元来防治该种病害。

紫金山是我国松材线虫病的首先发现地，受此病危害已达30年，自1982年首次发现以来，松材线虫病对紫金山松林造成了极大危害，已累计死亡松树21万株，损失木材4万多立方米。

事实上，由于松材线虫病及其他因素的影响，也促使紫金山的林相结构发生了极大变化，经过治理后，据近几年的调查，紫金山现有野生植物700多种，国家保护植物12种，南京地区珍稀植物9种，蕨类植物70余种。

松材线虫病是中山陵园高级工程师孙永春，于1982年秋首次在紫金山山北发现并被有关专家确认的。30年来，中山陵园管理局共投入专项资金达4158万元，人工150多万个，来治理该种病虫害。

物种多样性带来了生态的稳定性，紫金山是最早发现松材线虫病危害的地区，经过30年的防治，现在仍保留松林443.3公顷，占原有松林面积的1/3，从2000年至今，没有发生过大面积的病虫害，松材线虫病造成松树死亡数量也逐年递减。而且当松树死亡后，森林中就有替代树种长出，整个森林处于动态的稳定之中，现在紫金山生态系统的生物链更趋合理，更加平衡稳定。

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