百日草黑斑病又称褐斑病。在全国各地均有发生。被侵染植株的叶子变褐干枯，花瓣皱缩，影响观赏。

叶、茎、花均可遭受此病危害。叶片上最初出现黑褐色小斑点，不久扩大为现规则形状的大斑，直径为2毫米～10毫米，红褐色。随着斑点的扩大和增多，整个叶片变褐干枯。茎上发病从叶柄基部开始，纵向发展，成为黑褐色长条状斑。花器受害症状与叶片相似，不久花瓣皱缩干枯。幼苗期，茎的基部受害时，形成深褐色中心下陷的溃疡斑，病斑逐渐包围茎部，使小苗呈立枯病症状。 

病原为真菌百日草链格孢 A lternaria zinniae Pa-pe。 

病菌在病叶、病茎等残体上越冬。带病的也可能成为初次侵染源。病菌借风雨传播，在百日草整个生长过程中都可侵染。特别是在高温多湿的气候条件下，发病最为严重。 

1、选择排良好的地段种植。栽植密度要适当。避免连作。种子播前要进行消毒处理（用50％多菌灵可湿性粉剂1000倍液侵种10分钟）。秋后，病叶、病茎等集中销毁，消灭来年的侵染源。从无病的健康母株上留种。

2、化学防治：可定期喷施国光银泰（80%代森锌可湿性粉剂）600-800倍液+国光思它灵（氨基酸螯合多种微量元素的叶面肥），用于防病前的预防和补充营养，提高观赏性；
  发病初期，病初期喷洒25%咪鲜胺乳油（如国光必鲜）500-600倍液，或50%多锰锌可湿性粉剂（如国光英纳）400-600倍液。连用2-3次，间隔7-10天。