万寿菊茎腐病又名万寿菊疫病，病害学名为Phytophthora cryptogea Pethybridge&Lafferty。此病还为害一串红、孔雀草等，分布于全国各地。

苗期、成株均可受害。苗期染病病苗基部初呈水渍状，渐变褐色，造成死苗。成株染病主要为害茎和花。近地面的茎染病后产生长条形皱缩状褐色斑，茎部枯萎或引起根部腐烂，造成叶片枯萎或全株死亡。花冠染病亦变褐烂腐。

菌形态特征: 病原称隐地疫霉，属卵菌。在CA培养基上菌落均匀，放射状，气生菌丝少，菌丝形态简单，粗3—8um。菌丝膨大体球形至不规则形，孢囊梗不分枝，粗3—6um。孢子囊椭圆形，大小34—64X17～36(um)，顶部平展无乳突。游动孢子肾形，大小10～13X 8—10(um)。鞭毛长21—34um。休止孢子球形，大小8—13um。藏卵器球形。雄器球形至圆筒形，大小10—15X 7—18(um)。卵孢子球形，直径17～27um，壁薄，不满器。

以卵孢子在病残体上越冬。条件适宜时卵孢子萌发，产出芽管，芽管顶端膨大形成孢子囊。孢子囊萌发产出游动孢子，借风雨传播到寄主上侵染。后病部又产生孢子囊进行再侵染，到生育后期，病菌在病组织内形成卵孢子，进行越冬。 
温度和湿度是发病主导因子。25—28℃，连阴雨或雨后转晴，湿度高，易发病；8—9月雨日多、降雨量大该病常流行成灾。品种间抗病性差异明显：一般小万寿菊(孔雀草)、矮化万寿菊品种、法兰西万寿菊较抗病。非洲型品种最感病。 

(1)选用抗病的万寿菊品种。 
(2)苗床使用无病菌的土壤，提倡施用保得生物肥或酵素菌肥料，避免在地势低、湿度大的苗圃栽植万寿菊。发病重的地区要注意轮作。 
(3)精心养护，雨季到来之前开展预防性防治，并喷洒50%氟吗啉锰锌（如国光三治）400—600倍液或10%烯酰吗啉（如国光绿杀）400-600倍液、58%甲霜灵锰锌500-600倍液、70％乙膦铝·锰锌可湿性粉剂400倍液等药剂进行防治，隔10天左右1次，防治2—4次。