苜蓿镰刀菌根腐病是苜蓿常见病害之一，我国主要分布新疆、甘肃、内蒙古、吉林和北京等地区。 

此病主要侵染根部，发病初期根部产生水渍状褐色坏死斑，严重时整个根内部腐烂，仅残留纤维状维管束，病部呈褐色或红褐色。湿度大时，根茎表面产生白色霉层(即为分生孢子)。由于根部腐烂病株易从土中拔起。发病植株随病害发展，地上部生长不良，叶片由外向里逐渐变黄，最后整株枯死。

苜蓿镰刀菌根腐病又称镰孢根腐病，属半知菌亚门真菌。菌落初为白色，后渐变为桃红色。病菌产生2种类型的分生孢子，大型分生孢子镰刀型，多细胞，有3个隔膜，具明显脚胞，大小28.9～42.lμmX4.6～6.2μm，可产生厚垣孢子;小型分生孢子单胞，无色，椭圆形至纺锤形，偶有l分隔，大小9.2～14.5μmX5.2～5.9μm。

根腐病为土壤习居菌，主要以菌丝体、厚垣孢子在土壤、病残体和带菌种子中越冬，成为主要初侵染源。病害发生流行的主要因素是土壤温度和湿度，根腐病菌的生长最适温度为25～30℃。土壤湿度大，地下害虫发生多，连作地块往往发病较重。 

(1)选用抗病品种，如Affinity十Z、CW227、CW301、CW400、WL232HQ、WL324等。

(2)选择地势较高，排水良好的砂壤土或壤土地种植苜蓿。

(3)及时防治地下害虫及线虫，减少伤口侵染。

(4)加强田间管理，及时清除病残体，并集中销毁。生长期适时浇水施肥，促进根系生长。

(5)发病严重的地块可实行3～5年的轮作。

(6)种子处理: 建植时进行药剂拌种或种子包衣，可选择福美双、代森锰锌、甲基托布津等药剂，按种子量的0.2％至0.4％拌种。 

(7)药剂防治:在发病初期，可选用国光嘧菌酯、国光地爱、国光根灵等内吸杀菌剂喷雾或灌根。